خدمات الهيئة وبرامجها لا تستهدف تنمية الموارد البشرية وتأهيلها فحسب، بل تهتم أيضاً بتنفيذ عدد من المشاريع التنموية المختلفة التي تعود بالنفع والفائدة على المجتمع اللبناني بشكل عام والمسلم والمحتاج بشكل خاص، لا سيما فيما يتناسب مع رسالة الهيئة وبتحقيق أهدافها.
من هنا تنوعت مشاريع الهيئة وتفرعت ومن هذه المشاريع :
- حفر وتجهيز عدد من الآبار والخزانات في القرى والمناطق المحتاجة مثل العباسية، العمروسية، طبايا، الهبارية يارين، شارنيه، كفرشوبا وغيرها.
- بناء وتجهيز قاعات ومراكز لإقامة حلقات العلم والمحاضرات التثقيفية، فضلاً عن أن بعضها يشمل مستوصفات وقاعات تدريس و قاعات رياضية، وذلك في مختلف البلدات في مدينة صيدا وضواحيها وقرى الجنوب المعنية، وكان آخرها بناء وتجهيز قاعة في بلدة الزلوطية الجنوبية.
كفالة عدد من الطلاب المهنيين ذوي الوضع الاقتصادي المتدني بدعم وتمويل من مؤسسات خيرية عدة.-
- بناء وترميم وتأهيل وتجهيز عدد من المساجد في مختلف مناطق الجنوب، كان آخرها مسجد ريحانة بري الواقع في القطاع الشرقي للجنوب اللبناني عند الحدود اللبنانية السورية.
تسيير مستوصفات مجهزة بالكامل في مناطق صور ويارين والهبارية، إضافة إلى تأمين عدد من العيادات النقّالة لاسيما في المناطق النائية التي تفتقر إلى الخدمات الطبية.
أمّاً االمشاريع المستقبلية التي تسعى الهيئة الى تنفيذها في السنوات اللاحقة فهي على النحو التالي :
1- مشروع المدرسة الشبه مجانية.
2- مشروع المدرسة النهارية.
3- ورشة مكانيك إنتاجية .
4- مركز أيتام الفيلات.
5- مشروع معمل صابون الغار.
6- مشروع مزرعة أبقار.